国人为何对转基因食品如此反感，是否如某位院士所说“是不负责任的宣传造成”，是“少数人把这个东西妖魔化了”的结果?还是如农业部农村经济研究中心副主任邓志喜所说“主要源于(公众)对于其的无知”?
事实上，从转基因生物诞生之后，学术界对这项新生事物的争议就没有中断过，各类实验也一直在进行之中，相关结论不断通过媒体披露。1998年，美国媒体专访了对英国罗伊特研究所普斯陶教授，教授他警告人们关注未充分证明其安全性就已经推广的转基因食品。2005年5月22日，英国《独立报》披露了知名生物技术公司“孟山都”的一份报告，以转基因食品喂养的老鼠出现器官变异和血液成份改变的现象。2009年5月，美国环境医学科学研究院以明确而强烈的言辞宣布：转基因食品对病人有严重的安全威胁，并要求社会公众尽量避免食用转基因食品。
正因为如此，多个国家对转基因食品有法律上的限制，如墨西哥禁止种植转基因玉米，欧盟暂缓进口转基因食品，日本、澳大利亚、新西兰等国家均要求在转基因食品上明确贴上标签，说明转基因成分的含量，英国的许多大超市禁止使用转基因生物作为原料生产食品。
同样，中国科学界对转基因生物的研究也一直在进行之中。此前，国内已有知情人士忧心忡忡地指出：“转基因食品的研究表明，耐除草剂的转基因大豆抗癌成份减少了，抗虫转基因玉米在提高害虫死亡率的同时也影响着益虫的成熟，小动物吃了转基因土豆会使内脏和免疫系统受损，那人呢……”
有专业人士表示，必须消除粮食法征求意见稿中的漏洞，尤其是考虑到转基因食品对人类和生物多样性的不确定影响。他认为，敦促立法者加速起草基因改造生物安全法，增强对转基因食品和其他食品的监管。否则，这部法律只会是表面文章。中国政府应重新考量转基因水稻商业化隐含的众多风险与不确定因素，考量转基因水稻的商业化进程，以保护中国最重要的粮食作物，保护农民生计。
转基因食品牵涉到国计民生乃至民族延续，需要环境学、遗传学、医学、食品学、经济学等多学科领域的共同研究并形成共识。由单一部门个别学者匆忙下结论甚或草率进口，是对国家、对百姓不负责任的做法。在这个问题上，发达国家的一些做法可以借鉴。如美国立法规定，每一种转基因食品上市前至少要经过3个部门的审查，农业部负责管理转基因作物的开发和田间试验，环保局负责评估转基因植物的环境影响，药管局则负责转基因食品和饲料的安全性评估。转基因食品上市必须符合传统的食品卫生标准，任何一种转基因食品上市都需要几年时间，并花费1000万至1500万美元搜集完成审批所需要的数据。
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